• YUKI FURUSE Lab

    (Formerly affiliated with KYOTO UNIVERSITY)

     

    古瀬祐気 研究室

     

     

    Photo courtesy of Luke Jerram

  • ウイルス感染症を

    細胞レベルから世界レベルまで

    統合的に理解する

  • Research Projects

    研究内容

    Three research projects are under way in our lab. We utilize both field data and experiment data with bioinformatics, modelling, and statistics

    フィールドから得られるデータ・実験によって得られるデータを用いて、情報解析・理論解析・統計解析を行っています。主に、下記の3つのテーマがあります

    Molecular Evolution of Viral Genome

    ウイルスゲノムの進化

    Influenza, Measles, RSV, Ebola, Coronavirus, Enterovirus, HIV

    By analyzing viral genome with bioinformatics such as phylogenetics and simulation, we are trying to understand how viruses have evolved adapting new hosts, acquiring drug resistance, transmitting from human to human, and spreading worldwide.

     

    ウイルスのゲノム情報をもとに、ウイルスが新しい宿主に適応し・薬剤耐性能を獲得し・ヒト-ヒト感染を繰り返し・世界中に拡がっていくなかでどのように進化してきたのかを系統解析やシミュレーションなどのバイオインフォマティクスによって明らかにします。

    Epidemiology of Viral Diseases

    ウイルス感染症の疫学

    Influenza, RSV, Ebola, Lassa fever, COVID-19, Sapovirus

    By analyzing field data and samples at hospital and community levels, we are trying to estimate prevalence of viral diseases and to find out risk factors for susceptibility and severity. This is a project in collaboration with Oshitani Lab in Tohoku University. We are currently working on acute respiratory infections and acute diarrhea among children in low- and middle-income countries.

     

    発展途上国の医療機関やコミュニティなどフィールドから得られたデータや検体を用いて、ウイルス感染症の罹患状況を調査し、さらに「罹りやすさ」や「重症化」に関わる危険因子を明らかにします。東北大学の押谷研究室との共同研究プロジェクトで、現在はおもに小児の呼吸器感染症と下痢症を対象に研究を行っています。

    Virus–Host Interactions

    ウイルスー宿主の相互作用

    Influenza, Enterovirus, Adenovirus, Herpesvirus, Mycobacterium

    Viruses utilize a variety of host's mechanisms for their replication and transmission. We are interested in a novel mode of virus–host interactions: how viral genome and its transcripts interact with host's factor. We perform experiments for this project, supported by Koyanagi Lab in Kyoto University.

     

    ウイルスは、感染した細胞の仕組み(宿主因子)を利用することで増殖・伝播していきます。私たちは、これまでに注目されていなかった「ウイルスのゲノムやその産物」と宿主因子の相互作用について実験を行っています。このプロジェクトは、京都大学の小柳研究室の協力のもとに進めています。

  • Other Activities

    研究以外の活動

    Global Health

    国際保健

    国際緊急援助隊やWHOなどを通じて、感染症の流行に対する活動をおこなっています

     

    関連ドキュメント

    国際保健に関する活動のエッセイ

    公衆衛生活動にまつわる体験談

     

    Japan

    Member of Japan Disaster Relief Team, JICA

    Member of Cluster Response Team for COVID-19, MoHLW

     

    Liberia

    WHO Consultant for Ebola Outbreak

     

    Nigeria

    WHO Consultant for Lassa Fever Outbreak

     

    Philippines

    Collaborator for Viral Disease Surveillance

     

    Thailand

    Participant of Clinical Training Course on Tropical Infectious Diseases

     

    USA

    Emerging Leader of Global Virus Network

    Lecture/Seminar

    教育・講演

    研究に関することはもちろん、キャリアや世界の医療状況などについても授業やセミナーを行っています。対象者は高校生から研究者・医療者までさまざまです。講演のご依頼もどうぞ

     

    関連ドキュメント

    研究や公衆衛生活動の紹介

    感染症とこころの論考

     

    Universities

    Tohoku University / Tohoku Medical and Pharmaceutical University / Tohoku Bunka Gakuen University / Miyagi University / Sendai Seiyo Gakuin College / Gunma University / University of Tokyo / International Christian University / Nippon Veterinary and Life Science University / Chiba University / Gifu Pharmaceutical University / Kyoto University / Kyoto Prefectural University of Medicine / Ritsumeikan University / Nara Medical University / Nagasaki University / Duke University / University of Maryland, Baltimore / University of Hong Kong / National Taiwan University
     

    Public institutes

    Japan International Cooperation Agency / Ministry of Health, Labour and Welfare (Japan) / Research Institute for Tropical Medicine (Philippines) / Ministry of Health and Social Welfare (Liberia) / Nigeria Centre for Disease Control
     

    Health facilities

    Sendai Medical Center / Japanese Red Cross Narita Hospital
     

    Educational organizations

    International Federation of Medical Students' Associations / Miyagi First Senior High School / Nara Prefectural Kokusai High School
  • Drop Us a Message

    連絡はこちらから

    Let's grab a coffee (or a beer) and have a chat! We are also looking for future collaborators :)

    質問・共同研究の提案・講演の依頼などありましたら、ぜひご連絡ください

  • Vision

    メッセージ

     

    Virus Research from Cellular to Global Level

     

    Infectious diseases are responsible for substantial morbidity and mortality and continue to be of great concern in both developing and developed countries. Viruses are among the most common causes of infectious diseases. To ensure better control of viral infections, we need to conduct further study to understand infectious diseases and viral pathogenicity.


    Following the recent appearance of a number of emerging infectious diseases, many researchers have raised concerns about the urgent need to tackle them but have viewed this from a variety of perspectives. These include the need for reports of their clinical characteristics, for epidemiological analysis to identify risk factors, for theoretical study to estimate and predict transmission dynamics, for evolutionary investigation to find the origins of the emerging pathogens, and for in vitro and in vivo studies to identify the mechanisms of the viral life cycle and pathogenesis. However, each of these areas of study is independent, and there is a lack of organic linkage between them.


    In our research, we would like to integrate clinical medicine, theoretical modelling, evolutionary biology, genetics, and molecular biology to gain a better understanding of viral diseases. Connecting various approaches to each other can deepen the analyses and, therefore, lead to innovative findings. The results obtained through one approach can be applied to another approach, and new findings can then be applied back to the original approach or to further different approaches. In this way, we could gain a more comprehensive understanding of viral diseases. These findings would make a contribution to place where outbreak/epidemic/pandemic exists.

     

    ウイルス感染症を細胞レベルから世界レベルまで統合的に理解する

     

    感染症は太古から人類にとっての脅威であり、抗生物質が発見され、いくつかのワクチンが開発された現代においても公衆衛生・医学上の重要な課題です。特にウイルスによって引き起こされる感染症については、いまだ特異的な治療法はほとんどなく、その病原性メカニズムの理解も十分とはいえません。


    新しい感染症が出現すると、多くの研究者が喫緊の課題として取り組みます。その病気に罹患した患者の臨床的特徴をまとめる研究、疫学的特徴を調べる研究、伝播・拡大の様子を数式化し流行の未来を予測する研究、流行を引き起こしたウイルスの起源を追究する研究、ウイルス学的な特徴を実験によって解明する研究など、これまでにも数多くの研究が相次いで発表されてきました。しかしながら、多くの重要な知見が明らかになる中で、個々の研究の間に有機的なつながりが欠けているという問題点がありました。


    私たちは、これらの臨床ウイルス学・疫学・数理生物学・進化学・遺伝学・分子生物学を統合させた研究を行っていきます。多角的なアプローチをとるのみに留まらず、1つの方法で得られた結果をほかの方法による研究に組み込み、その結果をもとの方法へと還元、あるいはさらに別の方法へと昇華させていくことを考えています。これによって有機的・発展的な新たなアプローチが可能となり、ウイルス感染症の統合的な理解を目指します。そして、研究によって得られた知見・成果を現場へと還元し、最終的にはウイルス感染症の制御に資することを目標としています。

  • Publications

    論文

    List in order of the date of publication

    Record in order of the number of citations

    With miscellaneous information (Not so timely updated. My bad :( )

     
    Is any paper interesting to you? Now, it's time to collaborate or even join in our team!

    興味のある論文がありましたら、ぜひコンタクトしてください